Прокуратурою міста Києва внесено припис Національному університету фізичного виховання і спорту з вимогою відшкодувати студентам кошти, нараховані за результатами індексації стипендії у 2008—2009 роках.
На порушення вимог законів України «Про вищу освіту» та «Про індексацію грошових доходів населення» університетом не проведено індексацію стипендії, в результаті чого 1254 студенти недоотримали понад 470 тисяч гривень.