Детективи Національного антикорупційного бюро за процесуального керівництва САП та оперативного супроводу ГУ КЗЕ СБУ повідомили екс-міністру інфраструктури України про підозру у вчиненні незаконних дій, через які державний бюджет недоотримав 30,5 млн грн. Як повідомили в управлінні зовнішніх комунікацій НАБУ, дії екс-посадовця кваліфіковано за ч. 2 ст. 211 Кримінального кодексу України — «Видання службовою особою нормативно-правового акта, що зменшує надходження бюджету всупереч закону, якщо предметом таких дій були бюджетні кошти в особливо великих розмірах».
За версією слідства, колишній міністр у грудні 2017 року видав наказ про зменшення усіх портових зборів (крім маякового) на 20 відсотків. Тоді як один із цих зборів — портовий (адміністративний) — є дохідною частиною державного бюджету і змінити його розмір могла лише Верховна Рада, а не міністр. Згодом Міністерство інфраструктури визнало, що наказ про зменшення зборів не досяг поставленої мети.
«Рішення тодішнього міністра про зменшення портового (адміністративного) збору призвело до ненадходження до державного бюджету у 2018 році 30,4 млн грн: із очікуваних 203,5 млн грн отримано 173,1 млн грн, — повідомили в НАБУ. — Ці дані підтверджені Держаудитслужбою та судовою експертизою.
Сам Володимир Омелян на своїй сторінці у Фейсбуці написав: «Минулої п’ятниці мене було запрошено до НАБУ дати додаткові свідчення у кримінальному провадженні щодо зниженням урядом України портових тарифів і зборів на 20 відсотків у 2018 році. Нагадаю, що зниження тарифу здійснювалося для збільшення товаро/вантажопотоку. Завдяки цьому зниженню морська галузь продемонструвала у 2018—2019 роках зростання більш ніж на 20 відсотків і зростає досі, попри кризу».