У Криму через складну будову регіональної карстової водоносної системи існує небезпека забруднення підземних вод і, як наслідок, забруднення води у водоймах.
Як повідомив на прес-конференції у Сімферополі перший заступник голови Республіканського комітету Автономної Республіки Крим з водного господарства й зрошуваного землеробства Едіп Гафаров, у зв’язку з цим учені Науково-дослідного інституту спелеології і карстології при Таврійському національному університеті ім. В. І. Вернадського розробили програму збереження підземних вод Криму. В її рамках планується вивчення карстової системи Криму, і будуть дані висновки щодо забезпечення безпеки підземних вод. «На цю програму потрібно 300—350 тисяч гривень, і ще 150 тисяч гривень на її щорічне обслуговування. Гадаю, це не такі великі кошти, їх треба надати», — зазначив заступник голови. За його словами, у разі реалізації програми можна буде без небезпеки заподіяння шкоди навколишньому середовищу давати дозволи на організацію сміттєпереробних підприємств або будівництво заводів.